De werking van eileiders kan verstoord geraken door ontstekingen of endometriose.
Ontstekingen kunnen aanleiding geven tot vergroeiingen rond de eileider, tot vernauwingen van de eileider (fimosis) of tot afsluitingen van de eileider (hydrosalpinx). In dit laatste geval zal de eileider zich vaak vullen met ontstekingsvocht. Bij ernstige hydrosalpinx zal ook de binnenwand van de eileider beschadigd zijn.
Met de laser (zie ook laser-laparoscopie) kunnen vergroeiingen weggelaserd worden, een fimosis kan worden hersteld zodat de eileider weer vlot een eitje kan opvangen dat vrijkomt uit de eierstok. Een afgesloten eileider kan worden geopend. Vervolgens wordt de binnenwand bestudeerd. Als deze nog van goede kwaliteit is zal de chirurg de eileider verder herstellen zodat ze opnieuw een eitje kan opvangen en transporteren naar de baarmoeder. Als de binnenwand te erg beschadigd is zulke ingreep niet zinvol. De eileider zal na geringe tijd terug afsluiten en ondertussen aanleiding kunnen geven aan een buitenbaarmoederlijke zwangerschap. Daarom wordt vaak in samenspraak met de vrouw besloten om in deze omstandigheid de eileider volledig te verwijderen.